向日葵在生長前期有時候會出現分枝(分杈)的現象，很多人把這種情況簡單的歸咎于種子的“純度”問題，其實只要購買正規公司的雜交種，種子純度都是符合國家標準的。向日葵分枝出現的最主要原因是受到了生理脅迫，絕大多數的分枝會隨著向日葵生長而自動脫落，但是若受到極端氣候影響導致向日葵分枝情況嚴重，有條件應采取打杈措施。

向日葵出現分枝的主要原因：

1 、生育前期低溫冷害，造成生長發育遲緩，易產生分枝。
2 、8～12片葉期間及現蕾前，在一定的干旱過程后，突然灌水或降雨會造成營養運輸失衡，引發及促進腋芽分化，長出分枝。
3  、向日葵的根系發育與地上部分的發育是通過維管束相互影響的，當田間作業農機具（犁鏵）造成向日葵須根受損時，可能出現分枝。
4  、單株營養面積過小，營養不足土地瘠薄也可能造成營養分枝出現。
5  、播種時不帶種肥，苗期不松土、不追肥、定苗過晚等，都可能使植株在營養生長階段發育不正常。株高0.8～1.2m，即開花，限制了株高增長，若采取“一炮轟”的大水大肥，也會造成分枝的出現。
6  、土壤缺硼主莖生長不良，腋芽常隨之分化，造成分枝。