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菌核病是向日葵主要的病害。近年來，隨著向日葵種植面積的不斷擴大，菌核病也呈趨重態勢，輕者減產2～3成，重者減產5～6成，甚至絕產�？梢哉f，菌核病是制約全區向日葵產業健康發展的主要因素之一。
一、危害癥狀
向日葵整個生育期均可發病，病菌可侵染根、莖、葉、花盤等部位，主要有根腐型、莖腐型、葉腐型、盤腐型4種癥狀，其中根腐型、莖腐型、盤腐型受害重。
二、與氣象條件的關系
雨量多，濕度大，既有利于當前的菌核病發生蔓延，又有利于病源菌留存土壤中。翌年病源菌多，再遇澇年，使發病愈加嚴重，適當晚播，錯開雨季發病輕。連作田土壤中菌核量大，病害重。特大干旱，抑制菌核病發生，大氣候背景決定了菌核病不會大的發生，當年的氣象條件又不利于菌核病發生發展。重茬利于菌核病發病是在適宜的氣候環境條件下發生的。
三、發生氣象條件預報
根據預報模型顯示，河套地區與赤峰市向日葵種植區向日葵菌核病氣象條件屬輕度發生年標準，河套地區始盛期為7月22-26日。赤峰市始盛期為7月24-28日；烏蘭察布向日葵種植區向日葵菌核病氣象條件屬中度偏重發生年標準，且南部重于北部，始盛期為8月2-6日。
四、防治措施
1、輪作倒茬
向日葵菌核病屬土傳病害，可在土內存活3～5年，甚至更長。目前推廣的向日葵品種眾多，但其抗病性均不顯著�？刂葡蛉湛瞬〉淖罴汛胧┦禽喿鞯共�，不重茬、迎茬種植，輕病區輪作周期至少3年以上，重病區輪作周期至少5年。
2、深翻抑菌
向日葵收獲后，要及時將枯枝、根茬清除，并進行30厘米以上的深翻，將殘留地面及淺土層的菌核翻入深層，讓其在缺氧環境下難以萌發、侵染，減少病害的發生與流行。
3、增施菌肥
在施足磷鉀肥的同時，增施質量好的菌肥，以促進根系發育，增強植株抗病性，抑制病菌侵染。根據內蒙古等地近年的試驗示范，利根生﹙主要成分為淡紫擬青霉、抗線植物、抑菌微肥、腐殖酸、三江草炭、核心物質﹚不但可以活化土壤養分、促進根系發育、均衡供給作物微量元素外，還可在較短時間內快速增殖達到高峰期，通過占領生存空間和分泌抑菌物質抵抗某些病原微生物侵染，降低發病率。其方法是：結合播前施肥，每畝用利根生顆粒菌肥2.5千克，與化肥混勻后基施或撒施混土。建議農民朋友示范驗證。
4、生長期藥劑防治
向日葵現蕾至揚花前，可用40%施佳樂（嘧霉胺）懸浮劑1支（15毫升）、或50%速克靈（腐霉利）可濕性粉劑半袋（25克）、或80%邁銳（嘧霉·異菌脲）水分散粒劑1袋（10克）、或50%凱澤（啶酰菌胺）水分散粒劑1袋（12克）、或25%菌思福（啶菌·福美雙）1／2瓶（50毫升），對1噴霧器水均勻噴布花盤背面、葉片及莖部；揚花結束后，再用上述藥劑及濃度全株噴霧1～2次，以預防、救治盤腐型、葉腐型、莖腐型菌核病的發生與流行；根腐型菌核病的主要靠預防，而且必須加大藥劑劑量，可于灌頭水時，用50%速克靈（腐霉利）可濕性粉劑300～400克、或50%嘧霉胺可濕性粉劑500克隨水沖施。
